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exemple d`étude de cas corrigé

Schadt et coll. Ainsi, au moins 18% des échantillons ont été impliqués dans des mélanges d`échantillons. Pour traiter les éventuelles erreurs de génotypage des marqueurs au niveau des locus causals, nous avons pris les génotypes observés comme étant ceux ayant une probabilité multipoint maximale, à condition que cela dépasse 0. Avec ce sous-ensemble de sondes, nous avons ensuite calculé la corrélation entre l`échantillon i dans les tissus s et l`échantillon j dans le tissu t; appelez-le Rijst. Kathrine Johnson, Ph. Le modèle inhabituel d`expression dans l`hypo, avec une distribution bimodale pour les gènes chromosomiques Y chez les mâles et un grand nombre de femelles ayant une expression Xist relativement faible, était attribuable à un ensemble de 119 tableaux mal comportés. Ekstrøm et Feenstra 2012; Lynch et coll. Huijsmans et coll. Avant de regarder l`opération des comptes d`attente dans la correction d`erreur, nous devons penser à des types d`erreur parce que pas tous les types d`erreur affectent l`équilibrage des registres comptables et donc le compte d`attente.

L`expression génique a été analysée avec des microarrays à jet d`encre personnalisés de deux couleurs fabriqués par Agilent Technologies (Palo Alto, CA). Et pour les paires de tissus non compris les reins, Mouse3484 et Mouse3503 sont beaucoup plus faiblement corrélés. Le cas douteux dans le rein indique un mélange d`échantillon potentiel vêtu deux fois. Les échantillons de problème (vert coloré) sont généralement bien loin de la diagonale, ce qui indique un bon soutien pour notre capacité à déduire l`étiquette correcte. Malgré cela, la question ci-dessus est toujours jugée utile à des fins pédagogiques. Les points noirs indiquent que l`échantillon d`ADN correct a été placé dans le puits correct. Les mélanges d`échantillons dans les tissus s ont été identifiés comme des échantillons i pour lesquels la similitude d`individu, Riis, était petite, mais pour laquelle il existait un certain tableau avec une similitude élevée: maxj ≠ irijs est grand. L`approche la plus simple consiste à identifier d`abord des sous-ensembles de colonnes associées (dans lesquelles une colonne de X est associée à une colonne de Y), puis calculer une certaine mesure de similitude entre les lignes de X et les lignes de Y, à travers ce sous-ensemble de colonnes. Études de cas dans les corrections: exemples, exercices, points de discussion, et les entrevues de praticien est le compagnon idéal pour une variété de manuels de corrections. Pour le gastroc, il y avait un swap d`échantillon unique, entre Mouse3655 et Mouse3659. Les données du génotype et de l`expression génique sont disponibles à l`archive QTL, qui fait maintenant partie de la base de données de la souris Phenome: http://phenome. Dans un intercross de souris avec plus de 500 animaux et des données d`expression génique à l`échelle du génome sur six tissus, nous avons identifié une proportion élevée (18%) de mélanges d`échantillons dans les données génotypes.

Dans ces rangées, nous avons déduit l`étiquette correcte comme étant celle de la valeur maximale hors diagonale, à condition que ce maximum soit grand et qu`il soit bien au-dessus de la deuxième valeur la plus grande. Pour l`îlot, il y avait trois eqtl avec trois sondes correspondantes, et pour adipeux il y avait un tel trio. Dans un intercross de souris avec plus de 500 animaux et des données de microarray d`expression génique sur six tissus, nous avons identifié et corrigé les mélanges d`échantillons impliquant 18% des ARN, ainsi qu`un petit nombre de mélanges dans chaque lot de matrices d`expression.